起苗后，苗木根系如果长时间暴露在阳光下，或被风长时间吹袭，会降低苗木栽植的成活率，影响苗木栽植后的生长。为了使出圃苗木的根系在挖起后不致失水和被折断，并保护苗木的树体(特别是嫁接苗)不受机械损伤，在苗木挖起后运输前，必须根据具体情况，对其进行适当的包装。
1.长距离(时间在1天以上)运输要求细致包装
各地苗木调运时，包装材料可就地取材，一般以价廉、质轻、坚韧并能吸水保湿，但不迅速霉烂、发热破散的为好，如草帘、草袋、蒲包、谷草束等，填充物可用碎稻草、锯末、苔藓等。绑缚材料可用草绳、麻绳等。包装小苗时，将苗木根对根摆放在草帘上，苗根之间放一些湿润的填充物，然后捆好成包。
大苗包装时根系则向同一侧，用草帘把根包住，内部填加湿润的填充物，包裹之后用草绳或麻绳捆绑。用谷草束包装时，先将浸过水的谷草束，向四周均匀分开平放在地上呈圆盘状，再将湿润的填充物铺在草盘中央，将成捆的苗木立放在中间，然后把四周湿谷草包裹上来，并用绳子捆绑好。每包苗木的株数依苗木大小而定，通常50株或100株为一包。包装好后挂上标签，注明树种、品种、数量和等级等。
2.短距离(如1天以内)运输的苗木可以简易包装
将苗木散放在篓筐或木箱中，在筐(箱)底部铺塑料薄膜并放一层湿润物，再将苗木分层平放或立放在铺垫物上，并在根间填充湿润填充物，将筐(箱)装满后，最后在苗木上放一层湿润物。
3.带土球的大苗须单株包装
一般根据苗木所带土球的大小，采用草绳、蒲包、草袋、塑料袋或谷草束进行包装。树种珍贵，树体较大的带土球苗，还可进行双料包装。具体做法是：将已用上述材料包装好的带土球苗，稳固地放人已经准备好的篓筐或木箱中，然后用草绳将苗干与筐(箱)沿固定在一起，土球与筐(箱)中的空隙，用保湿的材料(也可用细湿土)填满压实，使土球苗在筐(箱)中不摇晃，稳固平衡。装
卸时要小心搬抬筐(箱)，以保护土球完好。为了保护珍贵苗木，顺苗立一个支柱，将苗干及苗梢捆绑在支柱上，以保证苗尖不受损伤。树冠也应用草绳轻轻绕缚，以防碰毁主枝影响树形。
4.容器苗在运输前的包装
有些容器如营养钵、纸袋和稻草泥浆杯等，不抗压、不抗挤、易松散。因此，运输前需要进行单株包装，再装筐或装箱运输。有些容器，如塑料薄膜袋、硬质聚乙烯塑料杯等，一般比较抗压、抗挤，也不易松散，可以直接装筐或装箱运输。
